Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms