Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COLEC12Q5KU26 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms