Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSZ5

PRRC2B, Protein PRRC2B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2BQ5JSZ5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2BQ5JSZ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2BQ5JSZ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2BQ5JSZ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2BQ5JSZ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2BQ5JSZ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2BQ5JSZ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2BQ5JSZ5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2BQ5JSZ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC2BQ5JSZ5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC2BQ5JSZ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms