Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS54

PSMG4, Proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4Q5JS54 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMG4Q5JS54 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMG4Q5JS54 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms