Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR3Q5GH77 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR3Q5GH77 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR3Q5GH77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms