Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO2Q562F6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms