Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDCA8Q53HL2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDCA8Q53HL2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDCA8Q53HL2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms