Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSD17B12Q53GQ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSD17B12Q53GQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms