Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL12Q53G59 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms