Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms