Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
DUSP28Q4G0W2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms