Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP6Q3SY56 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms