Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NBPF1Q3BBV0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NBPF1Q3BBV0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NBPF1Q3BBV0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms