Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C18orf21Q32NC0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C18orf21Q32NC0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms