Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms