Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC27Q2M243 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC27Q2M243 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms