Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF239Q16600 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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