Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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