Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRY1Q16526 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms