Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F4Q16254 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms