Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNCBQ16143 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNCBQ16143 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNCBQ16143 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNCBQ16143 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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