Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZIC1Q15915 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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