Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
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NCOA1Q15788 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
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NCOA1Q15788 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
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NCOA1Q15788 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
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NCOA1Q15788 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
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NCOA1Q15788 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
NCOA1Q15788 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
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