Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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