Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDSNQ15517 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDSNQ15517 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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