Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCOLCEQ15113 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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