Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL9A2Q14055 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL9A2Q14055 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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