Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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