Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAPSNQ13702 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms