Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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