Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPM6BQ13491 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms