Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN4PQ13434 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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