Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCGQ13326 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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