Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3FQ13275 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3FQ13275 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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