Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3BQ13214 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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