Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RESTQ13127 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RESTQ13127 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RESTQ13127 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RESTQ13127 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RESTQ13127 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RESTQ13127 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RESTQ13127 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RESTQ13127 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RESTQ13127 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RESTQ13127 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RESTQ13127 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RESTQ13127 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RESTQ13127 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RESTQ13127 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RESTQ13127 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RESTQ13127 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RESTQ13127 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RESTQ13127 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RESTQ13127 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RESTQ13127 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RESTQ13127 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RESTQ13127 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RESTQ13127 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RESTQ13127 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RESTQ13127 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RESTQ13127 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RESTQ13127 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RESTQ13127 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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