Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN3Q13064 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN3Q13064 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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