Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF2Q12947 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXF2Q12947 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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