Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD3Q12873 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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