Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 URC2YDR520C 2319 nt3.64□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 HCA4YJL033W 2313 nt3.64□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 LOS1YKL205W 3303 nt3.64□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 UGA3YDL170W 1587 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 ERG5YMR015C 1617 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YDR526CYDR526C 471 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 ECM34YHL043W 513 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 BNA1YJR025C 534 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 PAM18YLR008C 507 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YNL181WYNL181W 1224 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 AIM39YOL053W 1188 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 SPN1YPR133C 1233 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 SHE3YBR130C 1278 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 BUD5YCR038C 1929 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YPS7YDR349C 1791 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 TAF6YGL112C 1551 nt3.63□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 PPQ1YPL179W 1650 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 NOG1YPL093W 1944 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YKL177WYKL177W 339 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 GCD7YLR291C 1146 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 PFA4YOL003C 1137 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 WRS1YOL097C 1299 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 VPS21YOR089C 633 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 SWP82YFL049W 1872 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 RAD26YJR035W 3258 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 DHR2YKL078W 2208 nt3.62□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YOR022CYOR022C 2148 nt3.61□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 UBC8YEL012W 657 nt3.61□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 IRC6YFR043C 714 nt3.61□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 MMM1YLL006W 1281 nt3.61□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 POS5YPL188W 1245 nt3.61□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 GCN5YGR252W 1320 nt3.61□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YGL140CYGL140C 3660 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 ARO9YHR137W 1542 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 ARO80YDR421W 2853 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 FAD1YDL045C 921 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YGL074CYGL074C 327 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 APP1YNL094W 1764 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 PEP7YDR323C 1548 nt3.6□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YCL068CYCL068C 783 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YCR101CYCR101C 549 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 DIN7YDR263C 1293 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 NSE3YDR288W 912 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 SEC53YFL045C 765 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 YGR051CYGR051C 324 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 SAY1YGR263C 1275 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 GEP4YHR100C 558 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 FUR1YHR128W 651 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 DCS1YLR270W 1053 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 BLS1YLR408C 369 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 HMS1YOR032C 1305 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 SSU1YPL092W 1377 nt3.59□□□□□ -1.83
RPN6Q12377 NUP159YIL115C 4383 nt3.59□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 STU1YBL034C 4542 nt3.59□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 GZF3YJL110C 1656 nt3.59□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YGR219WYGR219W 342 nt3.58□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 AIM22YJL046W 1230 nt3.58□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 OSW1YOR255W 837 nt3.58□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 MET16YPR167C 786 nt3.58□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 CLB5YPR120C 1308 nt3.58□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 MSN4YKL062W 1893 nt3.58□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 SWI1YPL016W 3945 nt3.58□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 XRS2YDR369C 2565 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 MAF1YDR005C 1188 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 TAF10YDR167W 621 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 UTP6YDR449C 1323 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YHP1YDR451C 1062 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 SDT1YGL224C 843 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 IGO2YHR132W-A 396 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 UTP11YKL099C 753 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YPT7YML001W 627 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 COQ5YML110C 924 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YOL024WYOL024W 519 nt3.57□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 EMC1YCL045C 2283 nt3.56□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YCL075WYCL075W 441 nt3.56□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 GRX6YDL010W 696 nt3.56□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 PRX1YBL064C 786 nt3.56□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YNL234WYNL234W 1281 nt3.56□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 MED7YOL135C 669 nt3.56□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 APE2YKL157W 2859 nt3.56□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 GAT2YMR136W 1683 nt3.55□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 POL31YJR006W 1464 nt3.55□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 CDC45YLR103C 1953 nt3.55□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 TRX3YCR083W 384 nt3.55□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YJL028WYJL028W 336 nt3.55□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 AUR1YKL004W 1206 nt3.55□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 IBD2YNL164C 1056 nt3.55□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 SPB4YFL002C 1821 nt3.55□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 SPS2YDR522C 1509 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 YLR345WYLR345W 1530 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 TCB3YML072C 4638 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 PDR12YPL058C 4536 nt3.54□□□□□ -1.84
RPN6Q12377 PMS1YNL082W 2622 nt3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 83.4 ms