Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 HRP1YOL123W 1605 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-BRQ12217 PRP2YNR011C 2631 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-BRQ12217 YKR078WYKR078W 1758 nt6.34□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 BDP1YNL039W 1785 nt6.34□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 EMP65YER140W 1671 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YDL187CYDL187C 330 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 DPP1YDR284C 870 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 RGI1YER067W 486 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YKL147CYKL147C 618 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 KTR2YKR061W 1278 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YMR315WYMR315W 1050 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YPL035CYPL035C 348 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 RPN7YPR108W 1290 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 NAT3YPR131C 588 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 THR4YCR053W 1545 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SSL1YLR005W 1386 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 HTS1YPR033C 1641 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 BAP2YBR068C 1830 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 ERG11YHR007C 1593 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YDL144CYDL144C 1071 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SLO1YER180C-A 258 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 CDD1YLR245C 429 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 PDR17YNL264C 1053 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 CMR3YPR013C 954 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 snR54snR54 86 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 NAM9YNL137C 1461 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 MSY1YPL097W 1479 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 FMP30YPL103C 1407 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SSE2YBR169C 2082 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YFR006WYFR006W 1608 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 RGP1YDR137W 1992 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 ECM38YLR299W 1983 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 MRM2YGL136C 963 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SOL4YGR248W 768 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 PRY2YKR013W 990 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YLR050CYLR050C 486 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 ADH3YMR083W 1128 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 ZIM17YNL310C 525 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 MSN1YOL116W 1149 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 VMA13YPR036W 1437 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YJL163CYJL163C 1668 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 TMN2YDR107C 2019 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 JHD1YER051W 1479 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 RSM24YDR175C 960 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YAR023CYAR023C 540 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SEC13YLR208W 894 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YOR277CYOR277C 309 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 snR3snR3 194 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YPK2YMR104C 2034 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 PMS1YNL082W 2622 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 BIK1YCL029C 1323 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 JEM1YJL073W 1938 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SPC1YJR010C-A 285 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YKL102CYKL102C 306 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 MCR1YKL150W 909 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SPH1YLR313C 1593 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SEN54YPL083C 1404 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SWT1YOR166C 1377 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 CYB2YML054C 1776 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 MUD2YKL074C 1584 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 MRPL9YGR220C 810 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 BNA1YJR025C 534 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 PET10YKR046C 852 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 MCM1YMR043W 861 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 SGE1YPR198W 1632 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 AVT4YNL101W 2142 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-BRQ12217 EGD2YHR193C 525 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 ASF1YJL115W 840 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 ERP1YAR002C-A 660 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 AHP1YLR109W 531 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 ERD2YBL040C 660 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CKA2YOR061W 1020 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YOR186WYOR186W 435 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YRO2YBR054W 1035 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 SRP101YDR292C 1866 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YPL109CYPL109C 1974 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 NMD5YJR132W 3147 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 BDF2YDL070W 1917 nt6.27□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 SEO1YAL067C 1782 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 TFB2YPL122C 1542 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CCT3YJL014W 1605 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 PBP4YDL053C 558 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YDL163WYDL163W 303 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 FAL1YDR021W 1200 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 NCB2YDR397C 441 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YDR413CYDR413C 576 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 RMT2YDR465C 1239 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 PUP3YER094C 618 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 RTS3YGR161C 792 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 MRPL31YKL138C 396 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 CAR2YLR438W 1275 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YPT53YNL093W 663 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 RHO1YPR165W 630 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 YBR284WYBR284W 2394 nt6.26□□□□□ -1.41
TY1A-BRQ12217 PTC3YBL056W 1407 nt6.25□□□□□ -1.41
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