Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CGNL1Q0VF96 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CGNL1Q0VF96 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms