Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms