Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LMOD3Q0VAK6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms