Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLFN5Q08AF3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN5Q08AF3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms