Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLEQ07864 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLEQ07864 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLEQ07864 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLEQ07864 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLEQ07864 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLEQ07864 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLEQ07864 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms