Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FMODQ06828 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FMODQ06828 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FMODQ06828 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FMODQ06828 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FMODQ06828 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FMODQ06828 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FMODQ06828 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FMODQ06828 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms