Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNG1Q06432 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNG1Q06432 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms