Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	VHS3	YOR054C	2025 nt		4.4	□□□□□ -1.7
MRD1	Q06106	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.4	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	RPC17	YJL011C	486 nt		4.4	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	ELF1	YKL160W	438 nt		4.4	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	VPS21	YOR089C	633 nt		4.4	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	NAM9	YNL137C	1461 nt		4.4	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.4	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	SSU1	YPL092W	1377 nt		4.4	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	STV1	YMR054W	2673 nt		4.39	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YER077C	YER077C	2067 nt		4.39	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	NOC2	YOR206W	2133 nt		4.39	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	HSP42	YDR171W	1128 nt		4.39	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	GCD7	YLR291C	1146 nt		4.39	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YBL059W	YBL059W	582 nt		4.39	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.39	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	SRP72	YPL210C	1923 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	SLM5	YCR024C	1479 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	ALR2	YFL050C	2577 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	MSS2	YDL107W	1056 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	RPS13	YDR064W	456 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YJR112W-A	YJR112W-A	330 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YLR156W	YLR156W	345 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YLR159W	YLR159W	345 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YLR161W	YLR161W	345 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	TIF34	YMR146C	1044 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	GPI2	YPL076W	843 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	GRS2	YPR081C	1857 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	ATG2	YNL242W	4779 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	IDS2	YJL146W	1410 nt		4.38	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	BNA1	YJR025C	534 nt		4.37	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	POP6	YGR030C	477 nt		4.36	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	HMX1	YLR205C	954 nt		4.36	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	CDC73	YLR418C	1182 nt		4.36	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YPT53	YNL093W	663 nt		4.36	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	IRC14	YOR135C	342 nt		4.36	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	NCR1	YPL006W	3513 nt		4.36	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	PRP19	YLL036C	1512 nt		4.36	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	TEL1	YBL088C	8364 nt		4.36	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	HPR1	YDR138W	2259 nt		4.35	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	SRS2	YJL092W	3525 nt		4.35	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	ADH4	YGL256W	1149 nt		4.35	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	HIS6	YIL020C	786 nt		4.35	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	SWC7	YLR385C	399 nt		4.35	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	FSH3	YOR280C	801 nt		4.35	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	SEG1	YMR086W	2883 nt		4.35	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	NOG1	YPL093W	1944 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	PIM1	YBL022C	3402 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	BCH2	YKR027W	2298 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YCR101C	YCR101C	549 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YFR045W	YFR045W	930 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	MRPS35	YGR165W	1038 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YHB1	YGR234W	1200 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	PEX21	YGR239C	867 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YAE1	YJR067C	426 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	GMH1	YKR030W	822 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	SRP40	YKR092C	1221 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	NRK1	YNL129W	723 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	WRS1	YOL097C	1299 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	POL31	YJR006W	1464 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	UBP6	YFR010W	1500 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	VPS45	YGL095C	1734 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	PTR3	YFR029W	2037 nt		4.34	□□□□□ -1.71
MRD1	Q06106	TRK1	YJL129C	3708 nt		4.34	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	VMA1	YDL185W	3216 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	ALE1	YOR175C	1860 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	ERG5	YMR015C	1617 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YCL068C	YCL068C	783 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	COX4	YGL187C	468 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	RTA1	YGR213C	954 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	COX19	YLL018C-A	297 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	TMA16	YOR252W	537 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	STP22	YCL008C	1158 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	ECM22	YLR228C	2445 nt		4.33	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	PHO87	YCR037C	2772 nt		4.32	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	CLN2	YPL256C	1638 nt		4.32	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	RPP1A	YDL081C	321 nt		4.32	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	NUS1	YDL193W	1128 nt		4.32	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YDR290W	YDR290W	330 nt		4.32	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YGR149W	YGR149W	1299 nt		4.32	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	URA4	YLR420W	1095 nt		4.32	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	PRX1	YBL064C	786 nt		4.32	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	SRO7	YPR032W	3102 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	AAD3	YCR107W	1092 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YDL071C	YDL071C	375 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	PHO13	YDL236W	939 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	MAF1	YDR005C	1188 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YDR161W	YDR161W	1164 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YBL094C	YBL094C	333 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YOL166C	YOL166C	339 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	GLO4	YOR040W	858 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	MCD4	YKL165C	2760 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	PRP9	YDL030W	1593 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	UBP10	YNL186W	2379 nt		4.31	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YRB30	YGL164C	1323 nt		4.3	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	CDC14	YFR028C	1656 nt		4.3	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	IPI3	YNL182C	1668 nt		4.3	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YJL028W	YJL028W	336 nt		4.3	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	DID4	YKL002W	699 nt		4.3	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	TFA2	YKR062W	987 nt		4.3	□□□□□ -1.72

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.1 ms