Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDSPL2Q05D32 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms